Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DUSP28Q4G0W2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
DUSP28Q4G0W2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DUSP28Q4G0W2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DUSP28Q4G0W2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DUSP28Q4G0W2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DUSP28Q4G0W2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP28Q4G0W2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP28Q4G0W2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP28Q4G0W2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP28Q4G0W2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP28Q4G0W2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP28Q4G0W2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP28Q4G0W2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP28Q4G0W2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP28Q4G0W2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP28Q4G0W2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP28Q4G0W2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP28Q4G0W2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP28Q4G0W2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP28Q4G0W2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP28Q4G0W2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP28Q4G0W2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP28Q4G0W2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms