Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCK2Q16822 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms