Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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