Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CRY1Q16526 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CRY1Q16526 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CRY1Q16526 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CRY1Q16526 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CRY1Q16526 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CRY1Q16526 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CRY1Q16526 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CRY1Q16526 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CRY1Q16526 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CRY1Q16526 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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