Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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GABRA6Q16445 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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GABRA6Q16445 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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GABRA6Q16445 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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GABRA6Q16445 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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GABRA6Q16445 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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GABRA6Q16445 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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GABRA6Q16445 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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