Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SSX1Q16384 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SSX1Q16384 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SSX1Q16384 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SSX1Q16384 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SSX1Q16384 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SSX1Q16384 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SSX1Q16384 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SSX1Q16384 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SSX1Q16384 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SSX1Q16384 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SSX1Q16384 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SSX1Q16384 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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