Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms