Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms