Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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SYCP1Q15431 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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SYCP1Q15431 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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