Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.218e-8■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 SPATA18-209ENST00000511028 1919 ntTSL 222.63■■□□□ 1.212e-6■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 PPDPF-204ENST00000473620 478 ntTSL 218■□□□□ 0.472e-6■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.35■□□□□ 0.212e-9■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.152e-6■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.082e-6■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 SPATA18-205ENST00000505320 1911 ntTSL 514.5□□□□□ -0.092e-6■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 SPATA18-201ENST00000295213 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.562e-6■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 HLA-A-207ENST00000495183 1766 nt23.48■■□□□ 1.354e-40■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.354e-40■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.56■□□□□ 0.244e-40■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.234e-40■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 HLA-A-208ENST00000496081 1786 nt16.08■□□□□ 0.174e-40■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16■□□□□ 0.154e-40■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 CEP350-202ENST00000367607 13491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.763e-11■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 TPCN1-203ENST00000428632 2296 ntTSL 215.74■□□□□ 0.112e-11■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 TPCN1-202ENST00000392569 2558 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.692e-11■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 MTG1-208ENST00000498790 693 ntTSL 216.24■□□□□ 0.194e-8■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.368e-7■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 MADD-201ENST00000311027 5990 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.538e-7■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 MADD-204ENST00000395336 5942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.558e-7■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 MADD-209ENST00000406482 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.568e-7■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 MADD-207ENST00000402799 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.578e-7■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 MADD-210ENST00000407859 5744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.628e-7■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 MADD-206ENST00000402192 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.628e-7■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 MADD-202ENST00000342922 6005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.688e-7■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 MADD-205ENST00000395344 4988 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.848e-7■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 VAC14-210ENST00000568548 2945 ntTSL 1 (best)16.66■□□□□ 0.263e-10■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.233e-10■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 VAC14-211ENST00000568886 2151 ntTSL 1 (best)14.79□□□□□ -0.043e-10■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 VAC14-206ENST00000564685 892 ntTSL 1 (best)13.42□□□□□ -0.263e-10■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 VAC14-207ENST00000566416 780 ntTSL 39.06□□□□□ -0.963e-10■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.231e-6■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.043e-6■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.227e-7■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 FLNA-206ENST00000420627 8225 ntTSL 512.6□□□□□ -0.397e-7■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.467e-7■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.477e-7■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.547e-7■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.577e-7■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 EIF4A1-206ENST00000577929 696 ntTSL 217.16■□□□□ 0.343e-9■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.252e-6■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.12e-6■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.592e-6■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.12e-6■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 AKT1-208ENST00000554581 3916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.492e-6■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 AKT1-202ENST00000402615 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.662e-6■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 KLF13-206ENST00000558921 440 ntTSL 324.87■■□□□ 1.572e-8■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.62e-8■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.562e-8■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 KLF13-205ENST00000558844 574 ntTSL 213.15□□□□□ -0.32e-8■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 RBM10-205ENST00000496012 509 ntTSL 512.92□□□□□ -0.347e-7■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 CTDNEP1-205ENST00000570828 986 ntTSL 311.49□□□□□ -0.575e-8■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.368e-11■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.348e-11■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 P2RY11-202ENST00000471843 554 ntTSL 414.55□□□□□ -0.083e-7■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 EIF4A1-217ENST00000581384 642 ntTSL 59.8□□□□□ -0.843e-9■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 CALM2-207ENST00000484408 682 ntTSL 520.05■□□□□ 0.89e-10■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.479e-10■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.329e-10■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 CALM2-208ENST00000489742 522 ntTSL 315.07■□□□□ 09e-10■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 CALM2-203ENST00000432899 1004 ntTSL 512.27□□□□□ -0.459e-10■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 STPG4-206ENST00000422269 983 ntTSL 210.89□□□□□ -0.679e-10■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 CALM2-202ENST00000409563 770 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.969e-10■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 CALM2-204ENST00000456319 703 ntTSL 26.12□□□□□ -1.439e-10■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 AKT2-239ENST00000583859 567 ntTSL 523.98■■□□□ 1.432e-6■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.992e-6■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 AKT2-214ENST00000456441 582 ntTSL 319.58■□□□□ 0.722e-6■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 AKT2-228ENST00000537834 1402 ntTSL 217.85■□□□□ 0.452e-6■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 AKT2-221ENST00000487537 954 ntTSL 215.61■□□□□ 0.092e-6■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 AKT2-212ENST00000441941 974 ntTSL 414.81□□□□□ -0.042e-6■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.12e-10■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 AKT2-205ENST00000392037 681 ntTSL 213.62□□□□□ -0.232e-6■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 SLC20A2-204ENST00000518660 763 ntTSL 313.04□□□□□ -0.324e-8■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.351e-6■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 AKT2-207ENST00000416362 974 ntTSL 512.8□□□□□ -0.362e-6■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 SON-201ENST00000300278 7477 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.551e-6■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 AKT2-213ENST00000452077 577 ntTSL 310.9□□□□□ -0.662e-6■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 AKT2-224ENST00000492463 737 ntTSL 510.82□□□□□ -0.682e-6■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 SLC20A2-210ENST00000522401 577 ntTSL 49.95□□□□□ -0.824e-8■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 AKT2-229ENST00000578123 564 ntTSL 49.89□□□□□ -0.832e-6■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 AKT2-242ENST00000601166 554 ntTSL 59.61□□□□□ -0.872e-6■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 AKT2-209ENST00000423127 798 ntTSL 59.3□□□□□ -0.922e-6■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 AKT2-219ENST00000486368 606 ntTSL 49.26□□□□□ -0.932e-6■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 AKT2-223ENST00000491778 573 ntTSL 49.2□□□□□ -0.942e-6■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 AKT2-202ENST00000358335 546 ntTSL 49.16□□□□□ -0.942e-6■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 AKT2-241ENST00000596634 583 ntTSL 59.02□□□□□ -0.972e-6■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 PCNT-205ENST00000480896 10485 ntTSL 1 (best)10.28□□□□□ -0.761e-6■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 PCNT-201ENST00000359568 10560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.81e-6■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.583e-8■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.53e-8■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.652e-6■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 MST1-220ENST00000497359 1917 ntTSL 522.28■■□□□ 1.167e-12■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 MST1-204ENST00000479115 2285 ntTSL 520.95■□□□□ 0.947e-12■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 MST1-210ENST00000484673 1307 ntTSL 219.06■□□□□ 0.647e-12■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 MST1-215ENST00000492329 2006 ntTSL 518.39■□□□□ 0.537e-12■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 MST1-209ENST00000484269 1518 ntTSL 517.25■□□□□ 0.357e-12■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 MST1-216ENST00000492370 1374 ntTSL 1 (best)16.79■□□□□ 0.287e-12■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 MST1-205ENST00000480268 648 ntTSL 315.34■□□□□ 0.057e-12■■■■□ 23.6
PCBP2Q15366 MST1-218ENST00000494809 859 ntTSL 314.63□□□□□ -0.077e-12■■■■□ 23.6
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 213 ms