Protein–RNA interactions for Protein: Q15027

ACAP1, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP1Q15027 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAP1Q15027 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACAP1Q15027 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACAP1Q15027 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ACAP1Q15027 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACAP1Q15027 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACAP1Q15027 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACAP1Q15027 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACAP1Q15027 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACAP1Q15027 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAP1Q15027 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAP1Q15027 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAP1Q15027 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAP1Q15027 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAP1Q15027 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAP1Q15027 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAP1Q15027 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAP1Q15027 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAP1Q15027 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAP1Q15027 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAP1Q15027 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAP1Q15027 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAP1Q15027 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAP1Q15027 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAP1Q15027 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms