Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
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