Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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