Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
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NCOA4Q13772 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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NCOA4Q13772 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCOA4Q13772 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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NCOA4Q13772 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NCOA4Q13772 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NCOA4Q13772 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NCOA4Q13772 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCOA4Q13772 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCOA4Q13772 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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NCOA4Q13772 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
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NCOA4Q13772 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCOA4Q13772 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NCOA4Q13772 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCOA4Q13772 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCOA4Q13772 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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NCOA4Q13772 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCOA4Q13772 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCOA4Q13772 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCOA4Q13772 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NCOA4Q13772 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCOA4Q13772 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCOA4Q13772 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCOA4Q13772 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCOA4Q13772 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCOA4Q13772 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCOA4Q13772 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCOA4Q13772 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCOA4Q13772 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCOA4Q13772 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCOA4Q13772 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCOA4Q13772 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCOA4Q13772 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCOA4Q13772 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCOA4Q13772 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCOA4Q13772 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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