Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms