Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P11Q13670 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms