Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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