Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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CALCOCO2Q13137 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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CALCOCO2Q13137 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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CALCOCO2Q13137 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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CALCOCO2Q13137 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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CALCOCO2Q13137 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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