Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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