Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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