Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms