Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms