Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms