Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms