Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN1Q04323 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN1Q04323 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN1Q04323 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN1Q04323 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN1Q04323 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN1Q04323 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN1Q04323 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN1Q04323 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN1Q04323 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN1Q04323 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN1Q04323 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN1Q04323 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN1Q04323 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN1Q04323 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN1Q04323 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN1Q04323 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBXN1Q04323 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBXN1Q04323 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBXN1Q04323 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBXN1Q04323 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBXN1Q04323 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBXN1Q04323 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms