Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms