Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms