Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ID3Q02535 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ID3Q02535 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms