Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms