Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms