Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms