Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms