Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX16P57768 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX16P57768 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX16P57768 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX16P57768 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX16P57768 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX16P57768 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX16P57768 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX16P57768 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX16P57768 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX16P57768 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX16P57768 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX16P57768 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX16P57768 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX16P57768 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX16P57768 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX16P57768 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX16P57768 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX16P57768 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX16P57768 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX16P57768 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX16P57768 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX16P57768 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX16P57768 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX16P57768 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX16P57768 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX16P57768 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX16P57768 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX16P57768 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX16P57768 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX16P57768 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX16P57768 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX16P57768 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX16P57768 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX16P57768 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX16P57768 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX16P57768 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX16P57768 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX16P57768 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX16P57768 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX16P57768 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX16P57768 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX16P57768 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX16P57768 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX16P57768 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX16P57768 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX16P57768 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX16P57768 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX16P57768 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX16P57768 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX16P57768 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX16P57768 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX16P57768 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX16P57768 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX16P57768 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX16P57768 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX16P57768 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX16P57768 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX16P57768 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX16P57768 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX16P57768 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX16P57768 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX16P57768 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX16P57768 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX16P57768 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX16P57768 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX16P57768 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX16P57768 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms