Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms