Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIK1P57059 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIK1P57059 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIK1P57059 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIK1P57059 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIK1P57059 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIK1P57059 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIK1P57059 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIK1P57059 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIK1P57059 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SIK1P57059 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIK1P57059 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIK1P57059 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIK1P57059 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIK1P57059 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIK1P57059 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIK1P57059 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIK1P57059 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIK1P57059 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIK1P57059 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIK1P57059 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIK1P57059 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIK1P57059 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIK1P57059 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIK1P57059 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIK1P57059 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIK1P57059 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIK1P57059 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIK1P57059 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIK1P57059 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIK1P57059 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIK1P57059 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIK1P57059 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIK1P57059 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIK1P57059 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIK1P57059 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIK1P57059 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SIK1P57059 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SIK1P57059 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SIK1P57059 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SIK1P57059 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIK1P57059 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SIK1P57059 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIK1P57059 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIK1P57059 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIK1P57059 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIK1P57059 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIK1P57059 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIK1P57059 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIK1P57059 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIK1P57059 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIK1P57059 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SIK1P57059 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SIK1P57059 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SIK1P57059 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SIK1P57059 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SIK1P57059 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SIK1P57059 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIK1P57059 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIK1P57059 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIK1P57059 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIK1P57059 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIK1P57059 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIK1P57059 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIK1P57059 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIK1P57059 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIK1P57059 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIK1P57059 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIK1P57059 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms