Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MVDP53602 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MVDP53602 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MVDP53602 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MVDP53602 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MVDP53602 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MVDP53602 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MVDP53602 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MVDP53602 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MVDP53602 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MVDP53602 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MVDP53602 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MVDP53602 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MVDP53602 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MVDP53602 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MVDP53602 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MVDP53602 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MVDP53602 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MVDP53602 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MVDP53602 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MVDP53602 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MVDP53602 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MVDP53602 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MVDP53602 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MVDP53602 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MVDP53602 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MVDP53602 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MVDP53602 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MVDP53602 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MVDP53602 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MVDP53602 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MVDP53602 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MVDP53602 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MVDP53602 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
MVDP53602 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MVDP53602 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MVDP53602 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MVDP53602 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MVDP53602 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MVDP53602 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MVDP53602 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MVDP53602 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MVDP53602 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MVDP53602 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MVDP53602 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MVDP53602 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MVDP53602 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MVDP53602 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MVDP53602 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MVDP53602 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MVDP53602 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MVDP53602 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MVDP53602 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MVDP53602 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MVDP53602 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MVDP53602 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MVDP53602 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MVDP53602 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MVDP53602 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MVDP53602 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms