Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPAP49450 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPAP49450 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPAP49450 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPAP49450 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPAP49450 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPAP49450 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPAP49450 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPAP49450 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPAP49450 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPAP49450 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPAP49450 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPAP49450 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPAP49450 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPAP49450 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPAP49450 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPAP49450 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPAP49450 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPAP49450 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms