Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTBP49356 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTBP49356 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTBP49356 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTBP49356 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTBP49356 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTBP49356 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTBP49356 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTBP49356 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTBP49356 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTBP49356 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTBP49356 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTBP49356 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTBP49356 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTBP49356 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTBP49356 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTBP49356 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTBP49356 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms