Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms