Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSFMP43897 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSFMP43897 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSFMP43897 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSFMP43897 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSFMP43897 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSFMP43897 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSFMP43897 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSFMP43897 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSFMP43897 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TSFMP43897 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSFMP43897 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSFMP43897 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSFMP43897 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSFMP43897 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSFMP43897 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSFMP43897 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TSFMP43897 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TSFMP43897 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSFMP43897 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSFMP43897 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSFMP43897 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSFMP43897 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSFMP43897 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSFMP43897 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSFMP43897 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSFMP43897 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSFMP43897 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TSFMP43897 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSFMP43897 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSFMP43897 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSFMP43897 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSFMP43897 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSFMP43897 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSFMP43897 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSFMP43897 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSFMP43897 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSFMP43897 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSFMP43897 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSFMP43897 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSFMP43897 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSFMP43897 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSFMP43897 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSFMP43897 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSFMP43897 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TSFMP43897 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TSFMP43897 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TSFMP43897 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSFMP43897 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSFMP43897 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSFMP43897 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSFMP43897 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSFMP43897 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSFMP43897 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSFMP43897 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSFMP43897 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSFMP43897 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TSFMP43897 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSFMP43897 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSFMP43897 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSFMP43897 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSFMP43897 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSFMP43897 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSFMP43897 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSFMP43897 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSFMP43897 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSFMP43897 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSFMP43897 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms