Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP3P42574 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP3P42574 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP3P42574 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP3P42574 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP3P42574 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP3P42574 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP3P42574 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP3P42574 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP3P42574 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP3P42574 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP3P42574 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP3P42574 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP3P42574 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP3P42574 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP3P42574 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP3P42574 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP3P42574 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms