Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARL4AP40617 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARL4AP40617 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARL4AP40617 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARL4AP40617 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARL4AP40617 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms