Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBX2P40425 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBX2P40425 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBX2P40425 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBX2P40425 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBX2P40425 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBX2P40425 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBX2P40425 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBX2P40425 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBX2P40425 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBX2P40425 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PBX2P40425 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PBX2P40425 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PBX2P40425 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PBX2P40425 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PBX2P40425 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PBX2P40425 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PBX2P40425 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PBX2P40425 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PBX2P40425 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PBX2P40425 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PBX2P40425 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PBX2P40425 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PBX2P40425 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PBX2P40425 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PBX2P40425 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PBX2P40425 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PBX2P40425 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PBX2P40425 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PBX2P40425 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PBX2P40425 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PBX2P40425 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PBX2P40425 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PBX2P40425 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms