Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGCXP38435 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGCXP38435 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGCXP38435 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GGCXP38435 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGCXP38435 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGCXP38435 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGCXP38435 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGCXP38435 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGCXP38435 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGCXP38435 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGCXP38435 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGCXP38435 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
GGCXP38435 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GGCXP38435 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GGCXP38435 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GGCXP38435 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GGCXP38435 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GGCXP38435 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GGCXP38435 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms