Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJC1P36383 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJC1P36383 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJC1P36383 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJC1P36383 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJC1P36383 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJC1P36383 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJC1P36383 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJC1P36383 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJC1P36383 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJC1P36383 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJC1P36383 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJC1P36383 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJC1P36383 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJC1P36383 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJC1P36383 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJC1P36383 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJC1P36383 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJC1P36383 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJC1P36383 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GJC1P36383 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJC1P36383 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GJC1P36383 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJC1P36383 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJC1P36383 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJC1P36383 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GJC1P36383 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJC1P36383 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GJC1P36383 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJC1P36383 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJC1P36383 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJC1P36383 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJC1P36383 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJC1P36383 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJC1P36383 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJC1P36383 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GJC1P36383 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJC1P36383 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJC1P36383 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJC1P36383 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJC1P36383 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJC1P36383 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJC1P36383 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJC1P36383 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJC1P36383 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJC1P36383 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJC1P36383 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJC1P36383 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GJC1P36383 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJC1P36383 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJC1P36383 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJC1P36383 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJC1P36383 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJC1P36383 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJC1P36383 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJC1P36383 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJC1P36383 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJC1P36383 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms