Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms