Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLIP1P30622 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLIP1P30622 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLIP1P30622 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLIP1P30622 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLIP1P30622 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLIP1P30622 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CLIP1P30622 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CLIP1P30622 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CLIP1P30622 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLIP1P30622 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CLIP1P30622 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CLIP1P30622 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CLIP1P30622 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CLIP1P30622 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CLIP1P30622 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CLIP1P30622 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CLIP1P30622 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CLIP1P30622 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CLIP1P30622 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CLIP1P30622 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLIP1P30622 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CLIP1P30622 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLIP1P30622 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CLIP1P30622 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLIP1P30622 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms