Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB2P29033 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB2P29033 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB2P29033 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB2P29033 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB2P29033 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB2P29033 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB2P29033 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB2P29033 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB2P29033 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB2P29033 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB2P29033 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB2P29033 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB2P29033 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB2P29033 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB2P29033 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB2P29033 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB2P29033 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB2P29033 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB2P29033 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB2P29033 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB2P29033 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB2P29033 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB2P29033 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB2P29033 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB2P29033 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB2P29033 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB2P29033 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB2P29033 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB2P29033 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB2P29033 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB2P29033 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB2P29033 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB2P29033 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB2P29033 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB2P29033 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB2P29033 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB2P29033 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB2P29033 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB2P29033 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB2P29033 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB2P29033 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB2P29033 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB2P29033 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB2P29033 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB2P29033 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB2P29033 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB2P29033 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB2P29033 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB2P29033 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB2P29033 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB2P29033 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB2P29033 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB2P29033 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB2P29033 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB2P29033 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB2P29033 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB2P29033 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB2P29033 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB2P29033 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB2P29033 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB2P29033 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB2P29033 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB2P29033 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB2P29033 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB2P29033 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB2P29033 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB2P29033 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB2P29033 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB2P29033 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB2P29033 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB2P29033 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB2P29033 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB2P29033 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB2P29033 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB2P29033 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB2P29033 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB2P29033 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB2P29033 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB2P29033 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB2P29033 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB2P29033 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB2P29033 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB2P29033 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB2P29033 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB2P29033 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB2P29033 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB2P29033 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms