Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CTNNA2P26232 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA2P26232 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA2P26232 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA2P26232 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA2P26232 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA2P26232 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA2P26232 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA2P26232 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA2P26232 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA2P26232 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA2P26232 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA2P26232 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA2P26232 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA2P26232 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA2P26232 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA2P26232 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms