Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

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Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APCP25054 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APCP25054 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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APCP25054 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APCP25054 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APCP25054 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APCP25054 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APCP25054 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APCP25054 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
APCP25054 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
APCP25054 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
APCP25054 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APCP25054 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APCP25054 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APCP25054 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APCP25054 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
APCP25054 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APCP25054 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APCP25054 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APCP25054 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APCP25054 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APCP25054 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APCP25054 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APCP25054 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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